Ok, ma nel mio caso mi sembra eccessivo.
Da quando parte l'autorun a quando visualizzo il frame della mia applicazione passano circa 2/3 minuti, e il processo arriva a caricare un massimo di 45MB in memoria.
E poi molti programmi molto pesanti sono basati su java, ma vengono eseguiti comunque in breve tempo da CD, per questo mi sembra strano. Il mio file .jar è grande 68KB e le librerie che utilizza sono circa 3MB.

Questo problema mi si verifica solo quando il programma viene eseguito dall'autorun (e quindi con il jre che si porta dietro), perchè se io invece esploro il CD ed eseguo direttamente il file .jar questo parte subito, perchè si appoggia al jre che ho installato sul mio PC.