1) Forse non ho capito bene:

Tu ti crei una tabella ex-novo?

Se si,non dovrebbe cambiare nulla.

2) Altrimenti, non ho capito cosa dovrebbe cambiare, non so ne dove, ne quando aggiungi tr e td.

Infine un consiglio: dimentica le tabelle ( ) e fai il tutto con i contenitori che hai un maggiore controllo. Ad essere sincero, le tabelle mi stanno sui .... per una marea di motivi. Ecco che ho trovato un altro [motivo].



EDIT

Perché non fai qualcosa del genere:

codice:
cut......
function addtabella() {	
	html  = '<tbody id=" '">';
	html += '  <tr>';
	html += '    <td >content</td>';
        html += '  </tr>';
	html += '    </tbody>';
}
cut.......