A grandi linee visto che non so come è configurata la vostra rete e DC:

se è impostato in Active Directory uno script che all'accesso dell'utente x gli crea le mappature, non dovresti avere problemi perchè all'accesso dello stesso dovrebbe riconfigurare le impostazioni;

se invece è uno script che funziona in locale (ad es un batch messo in esecuzione all'avvio), devi riconfigurare le impostazioni che aveva la macchina originariamente.

Detto questo (detto praticamente nulla) ti sposto nel forum Microsoft Server.