Ti sconsiglio vivamente di utilizzare soltanto PayPal, sarebbe troppo limitativo e rischieresti di perdere delle vendite. Io ti consiglio, così come ha fatto Alhazred, di unire anche le carte di credito più utilizzate (Visa, Mastercard e American Express).
Se contatti direttamente loro ti forniscono le API già belle e pronte che tu dovrei soltanto implementare nel tuo codice.
Partire da zero con l'ecommerce è moooooooooooooooolto rischioso!