Nel senso che tu hai un testo, con PHP lo stampi sulla pagina e vuoi che i link siano cliccabili?

Se è questo che vuoi fare, allora metti il testo in una variabile, usi la funzione preg_replace per riconoscere i link all'interno del testo.
I link così trovati li sostituisci mettendoli dentro al tag indirizzo_trovato