Aggiungo una piccola nota a quanto detto da Alhazred. Se il tuo server è unix probabilmente hai un cpanel con il quale controllarlo. Bene puoi pianificare l'eseguzione di un file .php ( e quindi l'eseguzione di uno script ) attraverso la funzione cronjob. È semplice da usare e fai presto. Basta indicare il percorso del file che vuoi eseguire e dargli le coordinate di tempo che preferisci.
Spero sia di aiuto.
Ciao