Il problema di sicurezza si propone solo se la pagina web deve lanciare programmi eseguibili, in questo caso i browser si rifiutano di farlo perché gli eseguibili sono altamente pericolosi, pensa al fatto che se tu cliccando un bottone da un sito web ci potesse essere la possibilità che esso a tua insaputa lanci programmi e ti crei grossi problemi. La possibilità di lanciare eseguibili da una pagina web è possibile solo da browser che lavorano esclusivamente in locale e che non sono i soliti convenzionali.

Se poi il tuo script esegue operazioni che non siano lanciare eseguibili o componenti ActiveX, allora non hai alcun problema a farlo e in questo caso quello che funziona su Windows deve funzionare anche su Mac