... così:

char vocali[]="aeiouAEIOU";
char tuastr[20];
char output[20];

for (i=0; i<strlen(tuastr); i++)
{
for (j=0; j<strlen(vocali); j++)
{
if (vocali[j]==tuastr[i]) output[i]=tuastr[i];
}
}
output[i+1]='\0';

Magari ti formatta anche il disco fisso, non so...