se lo sfondo su cui andrà il logo schiarito è bianco, lascialo bianco, se deve essere di un altro colore, impostalo nel foglio di Draw, se sarà un'img, devi importarla: la stampante mica sa distinguere, lei stampa ogni pixel che vede, tutto appiccicato su di un piano. Che è esattamente quello che vuoi tu.
Se ti serve per il web può essere diverso, ma per la stampa non importa se le cose sono raggruppate, o su livelli diversi, o metà raster e metà vector.