Potresti usare il DOMDocument di MSXML della Microsoft. Ti permette di caricare un documento XML in una struttura ad albero (l'oggetto DOM appunto). lo stesso vale per documenti HTML (o meglio XHTML, poiché il parser del DOMDocument controlla che siano rispettate le regole del XML).
In sostanza potrebbe funzionare solo con quei documenti HTML che hanno una struttura valida secondo le regole stabilite per XML o comunque per XHTML. (In merito alle regole di base di XHTML puoi vedere http://www.html.it/xhtml/xhtml_04.htm).

Ti consiglio di documentarti sia su XHTML che su XML. Leggi anche alcune informazioni sul DOMDocument sul sito MSDN.

Resto a disposizione per ogni ulteriore chiarimento.
Ciao!