Ciao ,
Io (con xaraX faccio così):

Disegno l'area che voglio eliminare , seleziono entrambi gli oggetti (nel giusto ordine) ,sia l'oggetto di partenza che il nuovo oggetto , e poi li sottraggo.

In questo modo ti rimarranno nel disegno solo le zone che vuoi.

Se poi devi aprire o chiudere delle figure , devi selezionarle e poi editarne i nodi.

(con adobe dovrebbe essere simile!)