Prima inizializzo il controllo così:

<%@ Register tagprefix="NOMEPREFISSO" tagname="NOMETAG" src="pagina.ascx" %>

e poi lo richiamo dalla pagina così:
<NOMEPREFISSO:NOMETAG id="ID" var=<%# var1 %> runat=server />

e la cosa funziona tranquillamente.
Io il problema, cmq, l'ho risolto, perchè ho trovato un errore nel codice della pagina ascx. Infatti adesso questo tipo di scrittura funziona.
L'unico modo per inserire valori "dinamici" in un controllo è quello di farlo lato server con <%# %> perchè altrimenti nn funziona (almeno a me)

Ciao