Puoi essere un po' + preciso?
Cosa intendi per finestra attiva?
Le applicazioni sono entrambe sulla stessa macchina o sono su macchine diverse?
Le due applicazioni sono fatte da te?

In linea di massima quello che vuoi fare tu e' abbastanza facile da fare utilizzando Winsock (e conoscendo un po' VB), cmq restiamo in attesa di maggiori info....