Se vuoi tornare alla condizione iniziale, togli il segno di spunta dalla casella Build with runtime packages e compila nuovamente il progetto selezionando espressamente la voce di menu [Project][Build...] (forza la ricompilazione delle singole unit ricreando anche i file DCU).

Se questo non funziona o hai ancora dipendenze da file esterni, probabilmente hai fatto uso di qualche particolare soluzione all'interno del tuo file eseguibile (controlli ActiveX, librerie...) che fanno riferimento comunque a file esterni all'applicazione.

Ciao!