ok adesso è più chiaro. Secondo me puoi fare così


"main.jsp":
...
<%@ include file="menu.jsp" %>
...
int intPercorso=request.getParameter("perc");
if (intPercorso==1)
<%@ include file= "pagina1.jsp" %>
else
<%@ include file= "pagina2.jsp" %>
...


dove "perc" è un parametro che puoi passare nella barra di indirizzi dalla pagina che chiama main.jsp:
"http://main.jsp?perc=1"

se la pagina jsp nella "include file",invece, non è definita a priori(es.pagina1.jsp,pagina2.jsp ecc.), e vuoi quindi che la pagina jsp da includere sia un parametro del tutto generico, temo che ciò non sia possibile.

ciao