Da quello che scrivi immagino che tu utilizzi un qualche sistema che ti scarica i file in rete e i file li trovi in una precisa cartella (tipo dropbox).
Tu semplicemente punti a quei file per prove in locale.

A parte che è un sistema un po strano per lavorare (esistono servizi dedicati per questo, team fundation online è gratuito per 5 persone o esiste una versione express), ma cmq
Verifica che i il web.config non sia in readonly, poi prova a creare un utente locale della macchina ed associalo all'appPool con permessi di accesso adeguati.