Puoi aggiungere i dati in questione ai metadati EXIF (in particolare puoi usare il tag MakerNote); per fare questo, ti puoi appoggiare ad una libreria come questa.
Il problema è che ovviamente chiunque può modificare i dati in questione senza problemi; l'unica soluzione sicura a questo problema è usare la crittografia asimmetrica. Ogni installazione del tuo programma disporrà di un certificato contenente chiava privata e chiave pubblica, tramite il quale firmare digitalmente ogni immagine; in questa maniera, risulta possibile (possedendo semplicemente la chiave pubblica) verificare se un file è stato effettivamente firmato con la corrispondente chiave privata, e quindi rilevare immediatamente se il file viene da una determinata installazione del tuo programma o meno.