Potresti far fare a PHP il conto

timestamp_scadenza - timestamp_ora_corrente

questo rappresenta i secondi rimanenti fino alla scadenza.
Nel generare la pagina passi questo valore a Javascript e Javascript sulla base di ciò motrerà un countdown a partire dai secondi che ha ricevuto da PHP.

per timestamp intendo il tempo nel formato che ti restituisce la funzione time()