Ricavare la posizione del cursore (la | che lampeggia) in una textarea
codice:
<script>

var isSelected = false;

function markSelection ( txtObj ) {
    if ( txtObj.createTextRange ) {
        txtObj.caretPos = document.selection.createRange().duplicate();
        isSelected = true;
    }
}

function insertTag ( txtName, tag ) {
    if ( isSelected ) {
        var txtObj = eval ( "document.forms[0]." + txtName );
        if (txtObj.createTextRange && txtObj.caretPos) {
            var caretPos = txtObj.caretPos;
            caretPos.text = tag+caretPos.text;
            markSelection ( txtObj );
            if ( txtObj.caretPos.text=='' ) {
                isSelected = false;
                txtObj.focus();
            }
        }
    } else {
        // gestione perdita focus
    }
}

</script>

<form>
<textarea name="tsttxt"onselect="markSelection(this);" onclick="markSelection(this);" onkeyup="markSelection(this);"></textarea>
</form>
Il codice l'ho prelevato qui sul forum e non l'ho testato/provato
Se invece vuoi recuperare la posizione del mouse nel documento
codice:
<script>function posizioneMouse(event,obj){
  var scrollTOP = (document.documentElement.scrollTop) ? document.documentElement.scrollTop : document.body.scrollTop;
  var scrollLEFT = (document.documentElement.scrollLeft) ? document.documentElement.scrollLeft : document.body.scrollLeft;
  if(window.event){
   var allX = window.event.clientX+scrollLEFT;
   var allY = window.event.clientY+scrollTOP;
  } else {
   var allX = event.clientX+scrollLEFT;
   var allY = event.clientY+scrollTOP;
  }
  var elParent = obj;
  var objX = 0;
  var objY = 0;
  while (elParent){
   objX += elParent.offsetLeft;
   objY += elParent.offsetTop;
   elParent = elParent.offsetParent;
  }
  var x = allX-objX;
  var y = allY-objY;
  alert("Coordinata x:"+x+"px, coordinata y:"+y+"px");
}
</script>
<div style="width:200px; height:200px; background-color:#0FF;" onclick="posizioneMouse(event,document.getElementById('test'));"></div>
Anche questo non l'ho testato non mi sembra ci sia altro