Ripeto che in linea di massima se serializzi/deserializzi il solo TreeModel (e non JTree) non hai problemi di layout (visto che il JTree si presuppone che o lo stai per creare all'inizio quando crei la GUI oppure è già posizionato/dimensionato e visibile in un secondo momento) e comunque così eviti di salvare troppa "roba".
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