Da come descrivi, posso supporre solo un errore, che impedisce ai browser standard di processare il CSS, e che viene invece ignorato da IE.
L'errore puo` essere nelle prime righe del CSS, nella chiamata al CSS (il tag <link> o qualche riga precedente), o anche un'incompatibilita` tra la DTD (che si trova nel <DOCTYPE>) e il linguaggio usato.
Dato che non posti la DTD ne` il CSS, non possiamo capire dove sta il problema. La cosa migliore e` se posti il link.
Se ci sono errori, come dici in fondo al tuo post, devi prima toglierli.
Non ci possono essere due nomi di ID uguali nella stessa pagina

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