È piuttosto semplice; crea un oggetto Bitmap vuoto delle dimensioni richieste (nel tuo caso 100x100), quindi crea un oggetto Graphics per disegnare su di esso usando il metodo Graphics.FromImage. A questo punto, usa il metodo DrawImage dell'oggetto Graphics che hai creato per disegnare l'immagine sorgente sull'oggetto Graphics (ovvero sulla bitmap di destinazione), avendo cura di specificare come posizione di disegno -A (dove A è il punto in rosso sulla tua immagine).