Puoi fare benissimo un applicazione che fa partire il servizio quando qualcuno preme su un pulsante!
Altrimenti puoi andare nei servizi di windows e fallo partire manualmente.
Comunque se è un utente a far partire il programma è più semplice fare un'applicazione normale in cui l'unica cosa che c'è è un pulsante con scritto "Avvia"!! Il webbrowser e gli altri componenti li metti invisibili se non vuoi farli vedere.