Sì se il senso è solo che qualcuno con il permesso SUPER potrebbe impazzire e mettersi a fare dei danni, è uno sbattimento abbastanza inutile

Se non sei sicuro della struttura iniziale del database (perché non sai per esempio quale versione dell'applicazione era installata prima) ha molto più senso. MariaDB supporta una sintassi del tipo:

ALTER TABLE ... ADD COLUMN IF NOT EXISTS nome_colonna ...

https://mariadb.com/kb/en/alter-table/