Mancano molte informazioni per poterti aiutare: come stai gestendo i vari div? Per esempio, i vari div che vuoi si allineino nei vari punti, sono floated? hanno dimensioni fisse o no?

Sei conscio del fatto che se la div contenitore la fai adattare all'altezza dello schermo questo significa che se i contenuti sono più alti, questi verranno troncati o faranno apparire la barra di scorrimento, vero?

Insomma, dicci di più, o magari postaci anche un esempio online...