Ciao, funzioni ed eventi applicati tramite JavaScript/jQuery ad un qualsiasi elemento HTML, di norma non vengono mantenuti quando l'elemento viene duplicato. Credo quindi che dovresti applicare nuovamente la funzione jQuery al pulsante appena creato dopo che la riga viene duplicata.
Se non riesci, posta il codice in questione o, se possibile, posta un link alla pagina pubblica, così ti si può aiutare meglio.