chiariamo un paio di cose...
non si acquistano "sottodomini" perché non esistono in commercio.
puoi invece acquistare domini di terzo livello, la cui forma è: terzo.secondo.tld (tipo: maps.google.com)
se acquisti solo la gestione dei DNS non ti verrà creato alcuni spazio o cartella dedicata (visto che implicitamente hai dichiarato che ti arrangi tu a far puntare il dominio verso uno spazio che decidi tu, cosa non subito semplice o intuitiva. da non confondere con un redirect)
quindi... che hai comprato?
cosa intendi con "due domini distinti, ho deciso di unirli"?
volevi far diventare l'uno "terzo livello" dell'altro?