io non ci ho capito nulla allora
tu prendi il contenuto di un div e lo scrivi in un file (txt?)... gli a capo <br> li cambi quando lo scrivi nel file e hai l'impaginazione corretta nel file (txt)
poi se devi recuperare il contenuto del file (txt?) fai l'operazione inversa (per la cronaca, esiste un'apposita funzione nl2br() e se leggi i commenti c'è chi ha autocostruito la reverse br2nl() )

sara così quello che devi fare?