Il titolo della home page normalmente dovrebbe essere il titolo del sito che quindi rimane sempre indicato anche nelle altre pagine, a volte prima del titolo della pagina, a volte dopo a seconda di come è impostato nel tema.
Tu cosa vuoi fare esattamente? Eliminare il titolo del sito dalle altre pagine o piazzarlo prima del titolo della pagina?
In ogni caso si può intervenire utilizzando il filtro wp_title: http://codex.wordpress.org/Function_Reference/wp_title
Qui c'è un esempio che forse ti può servire: http://bavotasan.com/2012/filtering-...or-better-seo/