E' possibile eseguire una funzione javascript attraverso la header() ?

[Infocurci]

Dovresti impostare in maniera diversa il tuo script.
Una soluzione molto comune e valida è quella di usare un'unica pagina (magari con una statica html a cui reindirizzare l'utente quando ha inviato i dati con successo).

<?php
if($_SERVER['REQUEST_METHOD'] == 'POST' && isset($_POST['nome_tasto_submit']) ){
    //ha inviato il form. Verifica i dati.
    $errori = array();
    if(strlen($_POST['username']) < 5){
        $errori['username'] = 'Il campo username deve contenere almeno 5 caratteri.';
    }
    if($_POST['password'] != $_POST['conferma_password']){
        $errori['password'] = 'Le due password non coincidono';
    }
    //ecc.
    //se il form è corretto, ovviamente l'array $errori è rimasto vuoto...
    if(!empty($errori)){
        //esegue quello che deve eseguire (ad esempio inserire l'username nel database)
        header("Location: pagina-di-success.html");
        die();
    }
    else{
        //inizializza i dati con quelli già passati via POST, cosi puo pre-impostare il form
        $dati_precedenti = $_POST;
    }
}
else{ //non ha ancora inviato il form. Inizializza i dati con valori vuoti. Volendo, se ad esempio è una pagina di modifica dati, è possibile inizializzare questi valori con quelli ricavati dal database.
    $dati_precedenti = array('username'=>'Infocurci', 'citta'=>'Roma', 'professione'=>'Programmatore php'); //ecc ecc
}
//se arriva fin qui, vuol dire che NON è passato per l'header() inviato in occasione del form inviato con successo. Può quindi procedere direttamente alla stampa del form.
?>
<form>
    <input type="text" name="username" size="20" value="<?php echo $dati_precedenti['username'];?>" />
    <?php
        if(isset($errori['username'])){
            echo '<span class="error">'.$errori['username'].'</span>';
        }
    ?>
</form>