Non puoi chiamare una funzione PHP dall'evento onclick, onclick è Javascript ed esiste sul client (il pc da cui si naviga), PHP vive sul server (la macchina dove risiede il sito).
Quando tu vedi la pagina sul browser, PHP non esiste più.
Quello che puoi fare è: nell'evento onclick chiami una funzione JS che a sua volta tramite AJAX chiama uno script PHP sul server, eventualmente passandogli anche dei parametri, in cui c'è la funzione che cancella il file.

Per informazioni su come effettuare una chiamata AJAX chiedi nella sezione Javascript.