non conosco così bene TinyMCE quindi non so come si faccia a fare un template in html che non sia modificabile dall'utente
a meno che tu non intenda mettere l'editor in tanti campi form quante sono le etichette e dare all'utente la possibilità di formattare solo il testo

per quanto riguarda html/css e fpdf, se non ricordo male ci sono delle classi appositi che aiutano per la conversione (su html.it c'è una guida che tratta l'interazione php/fpdf)