Ciao, jQuery è una libreria di funzioni in JavaScript, come ce ne sono diverse altre.
Sostanzialmente serve per semplificare la stesura di codice JavaScript. Offre una sintassi più stringata per la selezione e la manipolazione degli elementi del DOM e "garantisce" (nella normalità dei casì) il cross browsing.

La riga che hai indicato serve, appunto, per includere tale libreria (cioè l'insieme delle funzioni) all'interno della tua pagina.