La pubblicità è fastidiosa quando diventa invasiva. Prendi il sito http://www.html.it/ : è un ottimo esempio di sito web dove la pubblicità è fastidiosa e invasiva, come ti sposti o muovi il mouse su determinate parti (anche involontariamente) si ingrandiscono immagini pubblicitarie e partono video. Da utente direi che è un esempio da non seguire.
Io con il mio sito (strutturato su due sole colonne) sto ancora effettuando dei test su dove e come posizionare i banner: al momento ne ho uno di 468x60 in alto a destra e un altro di 160x600 nella colonna a destra (a volte diventano due se la pagina è lunga, raramente uso quelli quadrati di piccole dimensioni). Nell'home page, che è diversa dal resto del sito, ho due colonne laterali e qui ho messo i banner sia a destra che a sinistra (oltre a contenuti "utili"). Nessun banner all'interno dei contenuti delle pagine. Non voglio esagerare.

Rispondi quotando