Motfeus, l'ordine non credo sia un problema. A me il sistema le valida tranquillamente. Stai attento ovviamente che la versione fatturaPA v1.1 va cambiata sia nel createElementNS che nel setAttributeNS, mentre la versione del domdocument rimane 1.0. Superfluo dire di controllare bene tutte le url. Se l'hai fatto e non funziona, l'errore potrebbe essere altrove.