Vuoi monitorare gli access attraverso la configurazione di apache oppure attraverso un linguaggio lato server?

Comunque in entrambi i casi devi analizzare l'header della richiesta http!
Se vuoi semplicemente risolvere il tutto basta aggiungere nella index un controllo simile

codice:
ARRAY = ["www.host1.com", "www.host2.com", "www.host3.com" ]
IF CHECK HTTP_HOST IN ARRAY THEN
    ADD_REFER(HTTP_HOST)
ELSE
    DOMAIN NOT FOUND
La funzione add_refer può fare qualsiasi cosa:
1. Contare solamente aggiornando un file
2. Aggiungere informazioni connessione ad un file
3. Contare su database
4. Aggiungere informazioni su database

Dipende tutto precisamente da come e cosa si vuole ottenere.