Ciao, puoi fare diverse cose e in vari modi.

Intanto puoi eliminare la ripetizione dell'istruzione var e usare la virgola.
Poi una prima soluzione per eliminare tutti quegli if può essere l'uso dell'operatore || (OR logico) direttamente sull'assegnazione del valore (che in questo caso, se non sbaglio, viene chiamata "valutazione a corto circuito"):
codice:
var morDal =  $("#morDal").val()||"",
    morAl = $("#morAl").val()||"",
    salMor =  $("#salMor").val()||"",
    intDal = $("#intDal").val()||"",
    intAl =  $("#intAl").val()||"",
    salInt = $("#salInt").val()||"",
    impCre =  $("#impCre").val()||"",
    impDeb = $("#impDeb").val()||"",
    impRim =  $("#impRim").val()||"",
    saldTot = $("#saldTot").val()||"",
     morUtePrec = $("#morUtePrec").val()||"",
    ImpCont =  $("#ImpCont").val()||"",
    numRat =  $("#numRat").val()||"";