Grazie per la risposta, ho provato ad usare la versione aggiornata ma da lo stesso identico output:
http://i.gyazo.com/0ff0c545bd2ff9008f73ad49d6234906.png
la funzione che uso è questa: $("#nestable").nestedSortable('toHierarchy'); e il div #nestable esiste e viene "prelevato" correttamente con jquery.
Tra le altre cose cercando online non trovo nessuno che abbia il mio stesso problema