non so se ho capito. Ho provato a pigliare il primo esempio che ho che visualizza una mappa con GoogleMap. Ho semplicemente aggiunto un <div id="map_canvas" ></div> con posizione assoluta. Ho duplicato il codice javascript e vedo tranquillamente n mappe.

Visto che siamo in una pagina aspx, non credo ci siano problemi scrivere quel codice javascript da server

Per quanto riguarda gli iframe, sono in dubbio che in questo caso servano.