Le opzioni per il comando "java" vanno messe prima del nome della classe da avviare... ciò che si specifica dopo sono argomenti che vengono passati al programma che viene avviato.

Per avere informazioni sul corretto uso del comando "java" basta digitare il comando senza nulla e poi dare invio:

codice:
Uso: java [-opzioni] class [argomenti...]
           (per eseguire una classe)
   oppure  java [-opzioni] -jar filejar [argomenti...]
           (per eseguire un file jar)
dove le opzioni sono:
[...]

Quindi, l'opzione "-classpath" (che può essere abbreviata in "-cp") va messa prima del nome della classe da avviare.

codice:
java -classpath"(directory di jdom.jar)" LeggiXml

Ciao.