Come libreria lascia molto a desiderare. Sembra molto antica, e non sembra portabile. È possibile che cambiando hosting, o aggiornando la versione di php (cosa che tra l'altro dovresti fare, la 5.2 è veramente pericolosa da usare), i dati cifrati creati con quella libreria in un altro ambiente non corrisponderanno più, una volta decriptati, ai dati originali.
Credo che ti convenga, capito il problema, provare a decriptare tutte le stringhe per poi risalvarle nuovamente utilizzando mcrypt_encrypt.