Non ho comunque capito il significato di $_POST['prodotti']/$_POST['prodotti']
Avevo copiato e incollato male, intendevo $_POST['prodotti'] e $_POST['id']. Sono entrambi array, quindi puoi lavorare come faresti con gli array. Puoi usare array_combine, o iterarli come preferisci. Cerca "foreach" nella documentazione.