Ricordati che Google Analytics aggiorna i dati una volta al giorno, a mezzanotte, i dati non sono in tempo reale.

Comunque va su una pagina del tuo sito dal browser, clicca col destro e seleziona "Visualizza sorgente pagina" o equivalente, a seconda del browser che usi, vedi se il codice di GA è presente.
Se è presente, PHP fa correttamente il suo lavoro e il tuo problema potrebbe essere il codice stesso di GA, che è in Javascript, in tal caso quindi chiedi aiuto nella sezione Javascript.