Non so di quante pagine sia il tuo sito, ma se sono molte potresti anche pensare di dare una classe alla pagina principale:

<body class="pagSenzaBordo">

e poi:
codice:
nav {
  ... formattazione con il bordo ...
}

.pagSenzaBordo nav {
  border: 0;
}
Ricorda che la formattazione del nav della pag principale deve essere dopo la formattazione del tutto
Non serve che riprogrammi tutto, ti basta definire gli attributi che danno il bordo (io ho semplificato con il border, ma potrebbe essere diverso nel tuo caso)