Rinomina structure.html, header.html, etc. in structure.php, ..., etc. Se contiene codice php da fare eseguire -> deve avere l'estensione .php.


structure.php
codice:
<!doctype html>
<html>
<head>
<meta charset="utf-8">
<title>Documento senza titolo</title>
</head>
<body>
<iframe
    srcdoc="<?php require "header.html"; ?>"
    width=100%
    height=100p
    frameborder="2">
</iframe>
<iframe
    srcdoc="<?php require "pannello.php"; ?>"
    width=100%
    height=300p
    frameborder="2">
</iframe>
<iframe
    srcdoc="<?php require "footer.php"; ?>"
    width=100%
    height=100p
    frameborder="2">
</iframe>
</body>
</html>

codice:
$username = "PAOLO";
include("structure.php");
Mi sfugge totalmente il motivo per cui stai utilizzando degli iframe.
Utilizzare un template engine come twig (http://twig.sensiolabs.org/) può esserti molto utile e ti semplifica la vita.