Gli unici collegamenti tra una pagina e l'altra sono i link nella barra di navigazione che portano alla home, al motore id ricerca per i rifugi, e ad altre 3 pagine, ma nessun link diretto alle singole pagine degli elementi dei database, che appunto vengono create dal php insieme al js...
In questo caso dovresti fare una Mappa del Sito, una pagina, dove elenchi tutte le pagine all'interno del tuo sito, in modo che i motori di ricerca le possano vedere.
I motori di ricerca seguono i link, se il link non ci sono non vedranno mai le tue pagine, non è succiciente il file sitemap.xml.

Dovresti considerare di effettuare una meta description migliore.

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Inoltre ti consiglio di dare un'occhiata a schema.org