Non ti so dire esattamente perchè, ma evidentemente il plugin di default (alla versione pre-aggiornata), era già configurato in modo che Wordpress inviasse correttamente le mail.

Aggiornandolo, è necessario "aiutarlo" a inviare la mail.
Tuttavia, dovresti risolvere con quel plugin. In teoria bisognerebbe sempre installarlo per fare in modo che CF7 invii correttamente le mail. Ma a volte, come nel tuo caso (prima di aggiornare CF7) non è stato necessario.

Sei riuscito a installarlo e a configurarlo ?