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La mia 1° domanda è se posso far funzionare i tasti di scelta rapida se il programma lavora in background.
Si, devi fare un Hook della tastiera, il che non è proprio semplicissimo. Googla "keyboard hook".

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La mia 2° domanda è se è possibile far aprire il programma in primo piano rispetto alle altre finestre...
Imposta la proprietà del Form "TopMost" a "True".