Aiuto MySQL - PHP

[Crios]

Fossi in te prima costruirei l'array contenente ciò che vuoi e con la struttura da te scelta, ed infine userei json_encode() sull'array finito.
Così come stai facendo tu sovrascrivi continuamente le variabili $data[CodTumoreDiffuso] e $data[DescrTumoreDiffuso] e ti troverai in fondo solo l'ultimo valore estratto dal DB

E come potrei fare?

Effettivamente hai ragione, sovrascrive ogni volta