Allora...
è dentro un echo" " e quindi non puoi usare " per delimitare il testo.
Se vuoi che il link finisca nella tabella, deve stare dentro il <td></td> e non fuori!

Inoltre in questo modo la pagina popup3.php non può sapere su quale $id lavorare: il name non viene passato attraverso un link ipertestuale

<td><a href='popup3.php?id='".$cicle['ID']."</a></td>